CNV指的是由于基因组重排而发生的拷贝数变异；它们通常导致基因组中超过1kb的大片段的扩大或缩小，是染色体缺失或复制在亚显微水平的表现；根据片段的大小，CNV可分为外显子CNV和大片段CNV。在全球遗传病核心数据库OMIM中列出了130多个染色体缺失和复制综合征，外显子CNV在单基因遗传病中也相当常见，在智力障碍、发育迟缓和多发性畸形等疾病中尤其普遍。
传统上，全外显子组检测只用于检测点突变和小的插入和缺失，但随着测序技术的发展，测序深度的增加和原始信号算法的迭代，近年来高通量测序技术在产前应用方面的指南和共识已经公布，WES/WGS技术已经逐渐应用于产前诊断、复杂儿科疾病诊断等领域。临床应用的一个重要趋势是覆盖范围逐渐扩大到外显子水平甚至是染色体水平的CNV。
2020年，华大基因推出了All-Exo+CNV-Seq的完整解决方案，经过不断的技术优化和升级，扩大了检测范围，缩短了检测周期，为多种胎儿畸形或复杂病例提供了更快、更准确的检测。今天，我整理了两个真实的临床案例与大家分享，请大家在评论区分享相关案例。
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1、临床案例1
2、案例描述
3、张女士是一名多发性硬化症患者，大龄生子，也是一名多发性硬化症患者。为了确定该病的家族性原因，张女士在华大基因做了全外显子家族检测。结果显示，婴儿在LMBR1基因的1-17号外显子中有一个拷贝数重复，基因型显示该变体来自母亲，父亲是野生型。该综合征是常染色体显性遗传，意味着胎儿从母亲那里继承了致病变体。
4、张女士整个家族的部分检测结果截图。
三拇指多指畸形综合征/AD
这是一种常染色体显性的肢体异常，涉及一个或多个类似拇指的结构，第一指有三个指节，拇指，第三至第五指完全合掌或第四至第五指合掌，第二指往往受影响较小，通常在下肢。
病例回顾
传统的异体检测中不包括CNV分析，而华大的产前异体检测产品可以准确地检测出外显子CNV，并提供快速和准确的临床诊断。然而，多发性硬化等疾病是相对复杂的疾病，不同检测机构使用的探针、不同的生化分析技术和数据库注释的程度不同，会导致报告位点的差异和不同的结果。因此，建议临床医生结合疾病本身、报告的检测范围和技术局限性，分析结果的可靠性，并在有明显临床症状的情况下，制定后续计划。
临床病例2
案例描述
何女士接受了妊娠检查，超声检查结果提示胎儿多发畸形。下颌畸形、双足畸形和皮肤水肿增厚的胎儿；随后，在孕周内发生流产。对流产的胎儿进行了染色体水平的微缺失和重复检测，但结果为阴性。随后，流产的胎儿被送到华大基因进行全外显系检测，结果显示，该胎儿携带了父方外显系CNV和母方DOK7基因的点突变。这两个变体形成了一个复合杂合体，导致了多种胎儿畸形和流产。
何女士的异体家族测试的一些结果的截图。
DOK7相关疾病介绍
先天性肌无力综合征10/AR型：CMS10是一种突触后传递障碍，具有典型的 "肢体腰部 "肌无力模式，神经肌肉接头小而简化，但乙酰胆碱受体和乙酰胆碱受体酶的功能正常。
胎儿运动畸形序列3/AR型：是一组临床和遗传上的异质性特征，包括胎儿运动障碍、宫内生长迟缓、关节挛缩和发育异常，如肺发育不良、腭裂和隐睾症。它与致死性多发性翼状胬肉综合征的表型重合。
病例回顾
本病例的情况在临床上比较常见：在常染色体隐性遗传病中发现一个致病/疑似致病的杂合子位点，与患者的表型密切相关，但找不到其他位点代表复合杂合子。在这种情况下，建议从检测本身的技术局限性出发，考虑另一条染色体上存在CNV或深内含子变异的可能性，并进行针对性的搜索。
结语
从以上两个案例可以看出，CNV全外显子组检测的性能提高了遗传病的检出率，为临床医生提供了一种新的思维方式和准确诊断的新方法。随着检测技术的发展和临床对不同类型变异体检测需求的增加，WES/WGS检测的前沿领域也在不断拓展，为疾病诊断提供更全面的解决方案，为患者提供更具性价比的检测产品。本着专注于产品和技术，造福于民的理念，WES/WGS将不断优化技术流程，完善产品服务，以技术支撑中国精准医疗的快速发展。